კონფერენციის მიმდინარეობისას პირველად მოხდება ვახუშტი ბაგრატიონის მედლების გადაცემა:
მედლის გადაცემა მიიღებს პერმანენტულ ხასიათს და ყოველწლიურად გადაეცემა ზემოთჩამოთვლილ კატეგორიებში სპეციალური წესით შერჩეულ კანდიდატებს.
კონფერენციის მსვლელობისას სპეციალური ჟიური შეარჩევს საუკეთესო პოსტერს და საუკეთესო ახალგაზრდა მეცნიერის მოხსენებას.
ორივე ნომინაციაში საუკეთესოს კონფერენციის დასკვნით დღეს გადაეცემა სპეციალური საჩუქარი.